故事发生在孟买圣雄甘地国家公园之中，一群动物在森林里快乐的生活着，直到有一天，人类的伐木机驶向了这片动物们赖以生存的家园。小豹尤为（塔拉·斯特朗 Tara Strong配音）的父亲死于猎人的枪下，悲痛之中，尤为召集了森林里的动物们，为它们的未来出谋划策。 小猴巴酱（范妮莎·L·威廉姆斯 Vanessa Williams 配音）提议正式和人类开战，大熊巴嘎（布拉德·加内特 Brad Garrett配音）不同意巴酱的看法，它希望能够找到一条和平解决问题的道路。商讨之下，一干动物决定去德里国家会议抗议示威，之后却发现它们没有人会说人类的语言，除了淡泊名利只想安静生活的鹦鹉艾利克斯（汤姆·肯尼 Tom Kenny 配音）。
上古时期，神工与鬼斧合力将祸害人间的海域统领蛟魔王囚禁于江海交汇处。为束缚住强大的蛟魔王，鬼斧牺牲肉身化作元神，注入神工所打造的用于囚禁蛟魔王的法器中。封神大战结束，墨麒麟和小蛟龙屡次触碰囚禁法器企图释放蛟魔王。于是在姜子牙的推荐下，玉帝决定启用曾经的战神二郎神来执行缉拿墨麒麟的任务。可在捉拿的过程中，二郎神却陷入了一场巨大的惊天阴谋中。
