千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……　　立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…　　那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。　　虽然基拉祈只能停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。　　不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？

故事承接第一部结尾，自从森林王子莫格利（海利·乔·奥斯蒙 Haley Joel Osment配音）认识了人类女孩珊迪（梅·惠特曼 Mae Whitman配音），便随她一同居住在人类村庄中。然而离开丛林生活的莫格利，却在新的环境里异常想念他的动物朋友们，尤其是待他非常好的黑熊巴洛（约翰·古德曼 John Goodman配音）。来自远方森林的召唤，让莫格利决定重新回到森林的怀抱中去。然而从前自由自在的森林生活，此刻却变得危机重重。老冤家老虎希瑞·坎（托尼·杰伊 Tony Jay配音）正在酝酿一场复仇计划。
　　由迪斯尼公司卡通片导演斯蒂夫·特伦伯斯执导的卡通片《森林王子2》，依旧保持着迪斯尼卡通片一贯轻松诙谐的风格笔调。著名童星海利·乔·奥斯蒙特是第四次为迪斯尼的卡通片配音，而倍受好评的配音演员约翰·古德曼此次更是倾情献声。流畅的故事情节，鲜活的人物角色，以及精美的配乐音效，《森林王子2》再次为您打造一场充满着纯真和关爱的丛林冒险故事。

照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难……
　　本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。

故事发生在中古世纪，阿祖尔是个金发碧眼的欧洲贵族，与父亲生活在豪华的宫殿中。与他共同生活的，还有奶妈和她的儿子——黑发、褐色皮肤的阿斯马尔。奶妈悉心照顾两个男孩，并且给他们讲述仙灵女的童话故事。但是随着阿祖尔慢慢长大，他父亲把他送到外面接受更专业的教育，并且解雇了奶妈，把她和阿斯马尔赶出了宫殿。
　　成年后的阿祖尔回到了宫殿，决定要外出冒险，却意外流落到了陌生的国度。在这片中东土地上，阿祖尔经历了多番波折之后，居然与奶妈和阿斯马尔重逢。随后，这两位代表着不同种族的王子——阿祖尔和阿斯马尔，都决定要去寻找仙灵女，途中他们遇到种种困难，互为竞争对手的他们能否救出仙灵女…

從片名【變身國王２：高剛外傳】可知，原本邪惡女祭司 Yzma 的那位傻大個助手 Kronk 將有大表現了，其實這角色當初意外成為全片最喜愛的角色，配音者 Patrick Warburton 還因本片被讚為該年度最佳喜劇表演，如今居然以配角之姿推出後續作品，真是傻人有傻福！本片的故事敘述 Kronk 當初幫助 Kuzco 國王復位，也讓自己脫離 Yzma 的暴虐統治，如今 Kronk 在王國中不但成為當地餐廳的主廚，而且還是童軍團的領隊，甚至在他生命中還出現心儀的女生 Birdwell，日子過得十分得意。不料有一天，他聽到父親即將來訪，這讓他分寸大亂，原來 Kronk 跟父親 Papi 之間關係不太投緣，Kronk 一直希望得到父親的認同，但 Papi 卻對兒子百般挑剔。如今聽到父親即將來訪，Kronk 心中忐忑不安，決定使出渾身解數贏得父親的歡心。他的朋友們也都鼎力相助，就連 Yzma 也在一旁幫忙出餿主意，但卻趣事連連、爆笑不斷。