某晚，中央城爆发激战，闪电侠巴里·艾伦（贾斯汀·钱伯斯 Justin Chambers 配音）和超人、蝙蝠侠、戴安娜、绿灯侠等正义联盟的伙伴们与来自25世纪的急速教授及其爪牙镜子大师、陀螺、速冻队长你来我往，最终将这群恶棍绳之于法。分别时刻，急速教授的一番话触动巴里心底最敏感的地方。在此之后，似乎一切都发生变化。他一觉醒来，发现无赖帮们继续为非作歹，自己则意外丧失了变身闪电侠的能力，更令他出乎意料的是本应在童年被盗贼杀害的母亲竟然活着出现在他面前。全世界仿佛也天翻地覆，戴安娜率领的亚马逊人以及亚特兰蒂斯阴谋毁灭世界，布鲁斯死去，他的父亲托马斯·韦恩则以粗暴的蝙蝠侠身份出现。

《史酷比狗》是史酷比狗的第一部大银幕动画冒险长片，讲述了史酷比不为人知的起源故事，以及神秘公司史上最精彩的惊世秘案。《史酷比狗》演绎了史酷比与其一生挚友夏奇的初次相遇，以及他们如何与少年侦探弗雷德、维尔玛和达芙妮一起组建了世界著名的神秘公司。如今，神秘公司已经解决了数百起谜案、进行了无数次冒险，但史酷比和他的同伴们发现，他们正面临有史以来最惊险、最具挑战性的神秘案件：一个将“幽灵狗”塞伯勒斯释放回世上的阴谋。当他们拼命努力想要阻止这一全球性大灾难之时，他们也发现了史酷比的秘密身世，以及他超乎想象的神秘命运。

帕奇（巴比·洛克伍德 Bobby Lockwood 配音）和家人伙伴们来到了车水马龙的繁华大都市伦敦，这里的一切都令帕奇感到新奇无比，在不知不觉中，帕奇竟然和家人们走散了，它很快就被淹没在了川流不息的车流和人流之中。
　　在伦敦，孤身一人的帕奇遇见了名为雷电（巴瑞·波斯威克 Barry Bostwick 饰）的狗狗，这可乐坏了帕奇，因为雷电是经常在电视上出现，风靡全球的明星狗狗，两只狗很快就成为了好友，结伴而行。在经历了上一次的失败后，贪婪而又邪恶的克鲁拉（苏珊·布莱克利 Susan Blakely 饰）并没有放弃她的阴谋，这一次，她联手名为拉斯（马丁·肖特 Martin Short 饰）的艺术家，企图用斑点狗的皮来制作艺术作品。

阳光明媚的一天，家中再次发生大混战，汤姆和杰瑞这对冤家你追我赶，飙完汽车开飞机，从屋内达到园子，甚至连睡觉的斯派克也加入战争。在这三个麻烦制造者的联合努力下，房子被夷为平地，满目疮痍。女主人气得将汤姆和杰瑞赶了出去，就在此时，他们看到一则消息。好莱坞制作人策划了一场飙车大赛，胜利者将获得一栋超豪华的别墅。两个家伙大喜过望，遂从废品场找来零件，东拼西凑做成了自己的赛车。
　　大赛如约举行，参赛者来自四面八方，各怀绝技，从美国到墨西哥，从北美洲到亚马逊丛林，从天空到海洋，超级紧张刺激的十项全能比赛吸引了所有人的眼球…

故事的主角是五个无恶不作的坏蛋——风度翩翩的扒手“大坏狼”、见多识广的保险箱窃贼“贪心蛇”、冷静沉稳的伪装大师“美肚鲨”、暴躁易怒的打手“食人鱼”、伶牙俐齿的黑客专家“骇客蛛”闪亮登场，他们是最臭名昭著的“坏蛋联盟”。他们平时威风八面，四处作案，令人闻风丧胆。直到某一天，他们突然想成为模范公民，然而转型路途甚是艰难，且意外层出不穷，令人啼笑皆非。