本片讲述的是蝙蝠侠（罗杰·克雷格·史密斯 配音）以及罗宾联合正义联盟成员闪电侠以及绿箭侠一起对抗被称为Animilitia的犯罪组织。该犯罪组织都是由一些动物性的成员组成，包括银背大猩猩、猎豹女、杀手鳄鱼等，他们在高谭市作恶多端，一般警察对他们束手无策。而且该组织背后的主谋却指向蝙蝠侠的宿敌，同时也是高谭市叱吒风云的黑道大亨企鹅人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia组织，蝙蝠侠他们这次还要面对奥斯瓦德公司的商人新发明的邪恶网络动物机器人，一群犯罪恶势力再次聚集在高谭市。

一艘海军潜艇在马里亚纳海沟神秘沉没，正义联盟派出钢骨维克多（Shemar Moore 配音）调查，谁知维克多却在事故现场遭到一伙神秘对手的袭击。在此之后，超人（Jerry O'Connell 配音）、黛安娜（Rosario Dawson 配音）、闪电侠（Christopher Gorham 配音）、绿灯侠（Nathan Fillion 配音）、蝙蝠侠（Jason O'Mara 配音）、神奇上尉等正义联盟伙伴相继云集总部，经联合调查后发现幕后真凶竟与古老的亚特兰蒂斯有关。这群深海战士在野心勃勃的奥姆王子的率领下向人类宣战，两个种族的全面战争一触即发。危机时刻，不久前刚刚承受丧父之痛的男子亚瑟（Matt Lanter 配音）成为事件的关键。
　　以此为契机，亚瑟以及整个正义联盟的命运都发生了改变…

这是一个居住在美国的印度移民家庭。温暖的阳光柔和地洒满客厅的地面，身穿超人服装的小男孩拿着公仔早早坐在电视机前，等待动画片《超级战队》的上演。客厅的另一头，男孩的父亲穿着传统服装坐在一个极具民族特色的柜子前，准备进行例行的礼拜。父子俩看似相安无事，但是电视机的聒噪让父亲有些烦躁。他先是调低声音，看儿子还不就范干脆关掉电视，命令儿子坐到自己身边来。男孩百无聊赖走了过去，公仔也被父亲没收。男孩木然盯着神龛里的印度教三神：神猴哈奴曼、吉祥天、毗湿奴，耳边则想起父亲吟诵咒语的声音。