一群王国之间摇摇欲坠的休战是通过禁止炼金术士来维持的。 然而，来自这些土地的一群炼金术士联合起来，实现了和平合作。

住在天空与海洋辉映的城镇“藤泽”的梓川咲太，就读高中二年级。 　　他与既是学姐又是恋人的樱岛麻衣所度过的令人雀跃的日常，随着初恋对象牧之原翔子的出现而改变。 　　不知为何，存在着“中学生”和“大人”两个翔子。 　　出于无奈开始和翔子住在一起的咲太，受到“大人翔子”的捉弄，和麻衣的关系也变得尴尬。 　　此时，“中学生翔子”身患重病的事实被发现，咲太的伤痕开始隐隐作痛——。

正在进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）、小遥（KAORI 配音）和小正（山田ふしぎ 配音），在前往下一个城镇的路上迷失方向。口渴难耐的他们在荒野中偶遇巡回表演的美丽少女洋美（眞鍋かをり 配音）及其所在的玛丽娜剧团，于是随着她们展开愉快的旅行。洋美是水之民的后代，她们此行的目的是将曾被海盗凡顿•绰普（藤岡弘 配音）夺去的苍海王子的蛋送回海之神殿，神殿内则藏着水之民的珍宝海之王冠。邪恶贪婪的凡顿岂能甘心失败，他将与洋美、小精灵护林员杰克（山寺宏一 配音）以及小智一行展开激烈的正邪争夺战……
　　本片为神奇宝贝系列第九部电影剧场版。

“天才”在被发现后开始塑造其轮廓。此时，天才前锋凪诚士郎的自我正征服世界！！ 　　把“好麻烦”挂在嘴边的高二学生凪诚士郎，整天过着百无聊赖的日子，直到梦想成为世界杯冠军的同校同学御影玲王发现了他的天赋。在玲王的邀请下开始踢足球的凪，发挥出了超乎想象的足球天赋。某日，他收到了“蓝色禁区”计划的邀请函，等待他的是与洁世一、蜂乐回、糸师凛这些从全国各地精挑细选出来的前锋们的集结。强强激战中，最终，天才凪诚士郎迎来“觉醒”时刻！

同作は、「ルパン三世」の原作誕生50周年を締めくくる記念作品。「ルパン三世 PART5」ブルーレイ＆DVD第1巻の先着購入特典として、約27分の映像がDVDに収録される。キャラクターデザインを「ルパン三世 PART5」の横堀久雄と、長年「ルパン」シリーズに関わってきたアニメーターの平山智、監督を「サイボーグ009VSデビルマン」の川越惇が担当し、メインキャストは栗田貫一ら、「ルパン三世 PART5」と同じメンバーが担当する。 　　公開されたオープニングは、ルパンが往年のライバルたちと迫力のカーチェイスを繰り広げるところからはじまる。また本編では、過去のシリーズでルパンと対決した摩毛狂介、百地三太夫、パイカル、ストーンマンらが登場し、第1シリーズの第1話「ルパンは燃えているか……?!」で敵の首領?ミスターXに捕われた峰不二子が完全再現されるという。川越惇監...

世界的崩溃开始了。
　　暴走的大缅因猫兽吸收了黑暗进化的迪路兽、
　　用强大的力量进化成了秩序兽。
　　根据世界树的想法，现实世界将被数码世界所吞噬。
　　在绝望迫近的时候，被选中的孩子们拼命地向前。
　　现在太一不在了，能代替他带队的只有大 和。
　　「为了拯救世界，我们还有必须要做的事情！」
　　加布兽的话给大和带来了活力，而亚古兽则坚信太一定会回来。
　　另一方面，恒常性要处置失去控制的秩序兽、
　　并尝试施行干涉现实世界的最终计划。
　　为了阻止毁灭的到来，被选召的孩子们和他们的搭档拼命地战斗。
　　「所有的光芒，都汇聚在了缅因猫兽…」
　　绝望的迪路兽向大家说到。
　　孩子们做出最后决定的时候到了。
　　被选中的孩子们，自己将选择怎样的未来？
　　现在，冒险将再一次进化。

在空地上，小夫（肝付兼太 配音）向大家炫耀现在最畅销的神秘火车的车票，胖虎（立壁和也 配音）和静香（野村道子 配音）恳求小夫也带他们去。这时，大雄（小原乃梨子 配音）急匆匆跑了过来，哆啦A梦（大山信代 配音）已经三天没回家，小夫和胖虎在一旁幸灾乐祸的笑着。晚上，哆啦A梦回来了，原来这三天他跑到了22世纪去买银河列车的车票。第二天晚上，银河列车在后山停站了，大雄和哆啦A梦开始了他们的银河之旅，车长（伊仓一恵 配音）总是笑嘻嘻，很有礼貌。另一边，神秘的生命体降落在了后山，是来自宇宙的寄居物，寄居物将自己附在人类的身体上，来操纵人的大脑，他们的目的是将整个地球毁灭掉。
　　在车上奇奇怪怪的事情发生不断，大雄在车厢外看到了一个忍者，小夫说看见了海盗，胖虎则看见了恐龙。哆啦A梦告诉大雄他们出现了一伙“神秘黑色影团”。遭到黑色影团的袭击后，列车在一颗行星上停下了，而冒险这才刚刚开始……